Фамилия образована от мужского имени Молей, которое которое может являться: 

а) производной формой имени Малей: превращение безударного а в о – один  из способов формирования нового имени. Имя Молей может быть:

– результатом модификации церковнославянского имени Малей (см. МАЛЕЕВ), что наглядно просматривается на этимологической цепочке образования нового имени от прежнего, а от последнего – фамилии: МОЛЕЙ < Молей < Малей;

– результатом многократной поэтапной модификации церковнославянского имени Мал (см. МАЛЕЕВ), что наглядно просматривается на этимологической цепочке образования нового имени от прежнего, а от последнего – фамилии: МОЛЕЙ < Молей < Малей < Мал; 

б) производной формой имени Мол: добавление окончания -ей к мужским именам – один из способов формирования нового имени. Имя Молей – результат многократной поэтапной модификации церковнославянского имени Молия, что наглядно просматривается на этимологической цепочке образования нового имени от прежнего, а от последнего – фамилии: МОЛЕЙ < Молей < Мол < Молия. Каноническое имя Молия в разные годы входило в многочисленные православные церковные календари, но отсутствует в современных месяцесловах, начиная с 1891 года. Этимология имени затуманена, возможно, она утрачена.

В результате исторического процесса имена и прозвища наших предков постепенно приобрели те стандартные формы, которые мы сейчас называем фамилиями. Однако не все фамилии прошли стандартизацию. И сейчас у русского населения встречаются фамилии в виде застывших личных имён, отчеств, прозвищ.   

Ударение в фамилии не регламентируется правилами русского языка, но для отличия фамилии от имени или прозвища ударение, как правило, переносят на другой слог. И всё-таки, ударение лучше уточнить у носителя фамилии.

Женская форма фамилии – МОЛЕЙ.

МОЛЕЙ Николай Николаевич.             

Участник Великой Отечественной войны.     

Читать по теме:

- См. Библиография. 6. Часть 1, стр. 218.

 - См. Происхождение фамилий. 2., 2.7., 4., 4.1., 4.1.7., 4.2., 4.2.1.